Tom et Diana, accompagnés d'autres agents du NTAC, se rendent dans une maison où ils pensent trouver Gary Navarro, un des membres du groupe Nova. Tom et Diana se rendent compte que Gary vient tout juste de partir et qu'il doit avoir été prévenu.
Pendant ce temps, des agents de l'Agence de sécurité nationale amènent Alana pour un interrogatoire. Ils pensent qu'elle pourrait avoir des liens avec le groupe Nova. De retour au NTAC, Tom est furieux qu'Alana soit détenue. Nina Jarvis explique que la NSA a confié à Haspelcorp, une entreprise du secteur privé, le soin de rechercher les personnes encore impliquées dans le groupe Nova. Alana est sur leur liste et Dennis Ryland dirige l'enquête de la société.
Le NTAC découvre que l'appel qui a prévenu Gary Navarro, provient du bureau de Heather Tobey, au centre des 4400. Mais ce n'est pas elle qui passé l'appel, elle enseignait. Heather révèle plus tard à Tom que la seule personne a avoir accès à son bureau est Alana. Tom garde ces informations pour lui.
Alana est finalement libérée et Tom lui demande des comptes. Alana avoue pour l'appel mais lui dit qu'elle avait ses raisons. Elle sait que Gary a eu tort, mais pour elle, il n'a fait que protéger Les 4400. De plus, Gary ne faisait plus partie du groupe Nova. Il a quitté le groupe après l'assassinat de T.J. Kim. Tom se sent trahi mais ne veut pas la dénoncer.
Au Centre 4400, la NSA arrête Heather pour avoir prévenu Gary. Même si elle n'a pas passé l'appel, la NSA est disposée à retenir Heather jusqu'à ce qu'elle trouve le véritable coupable. Refusant de laisser Heather payer pour son crime, Alana se rend.
En dépit de ce qu'elle a fait, Tom aime toujours Alana et ne peut supporter de penser à sa bien-aimée dans une cellule de prison. Il va voir Ryland et ils concluent un accord. Ryland libèrera Alana s'il obtient en échange Gary Navarro. Tom et Diana finissent par attraper Gary. Mais alors qu’ils effectuent le transfert de prisonniers, Tom a tout de suite envie de renverser Gary et de doubler Ryland.
Tom s'échappe avec Alana et Gary, mais ils sont maintenant en fuite. À la fin, Tom est obligé de dire au revoir à Alana s'enfuit avec Gary.
Pendant ce temps, Nikki revient inopinément dans la vie de Shawn, mais lorsqu'il devient évident que la jalousie d'Isabelle pourrait conduire à quelque chose de terrible, Shawn est contraint de repousser Nikki.