L’épisode débute alors que Nate McCullough, disparu le 8 septembre 2000, est poursuivi par le NTAC. Tous les 4400 doivent être rapidement mis en quarantaine. De son côté, Richard est inquiet de savoir que Lily s’est enfuit avec Isabelle, sans même avoir dit où elle allait. En réalité, Lily s’est réfugiée dans une maison fermée grâce à Brian, son ex mari.
Lily aperçoit quelques boutons sur son avant bras. Elle se dirige vers le miroir et découvre que son visage en est également envahit. Prise de panique, elle contacte le centre de secours, mais raccroche brusquement lorsqu’elle découvre que ces boutons ont disparu… Lily a des hallucinations.
Au NTAC
Ryland et Jarvis informent Tom et Diana que 8 revenants sont décédés. Tom et Diana ont du mal à se contenir, surtout après qu’ils aient découvert les raisons de cette « maladie ».
Diana n’en peut plus de cette situation, elle embarque Tom auprès du Docteur Max Hudson. Là-bas elle pointe son arme sur la tempe de ce dernier en lui demandant de tout leur raconter sur le champs. Hudson leur révèle alors tout dans les moindres détails : Le 12 octobre 2004, après la réapparition des 4400, il avait découvert un cinquième neurotransmetteur chez chacun des 4400 : la promicine. Dès lors il en avait déduit que cette substance était à l’origine des pouvoirs des 4400 et d’Orson Bailey entre autres. Washington en a été informé, et sous la panique ils lui ont ordonné de mettre au point une drogue capable de stopper la production de promicine chez les 4400. A partir de là, la drogue a été inoculée à chacun d’entre eux lors des examens médicaux. Ainsi cet inhibiteur a arrêté le développement des dons des 4400.
Alison rend visite à Kyle lui apprenant que son copain, Roy, va être emprisonner à perpétuité. Kyle la rassure et lui promet que son ami n’ira pas en prison. Quant à Diana et Tom, tous deux cherchent désormais des preuves contre Washington.
Kevin Burkhoff part se réfugier ailleurs qu’au Centre 4400 où il n’est plus en sécurité maintenant. Il rejoint donc les 4400 restants et Richard dans une maison de la ville. Burkhoff pense avoir trouver la solution, il lui suffit juste pour cela d’un 4400 qui n’aurait pas été exposé à l’inhibiteur. Richard pense alors à Isabelle !
Au NTAC
Ryland et Tom ont une discussion. Ryland, devinant que Tom est maintenant au courant de tout, glisse une enveloppe à Tom, dans laquelle se trouvent des photos compromettantes de Kyle. Ryland fait alors du chantage à Tom : Il ne révèle rien au sujet du meurtre de Collier en échange de quoi Tom ne parle à personne du programme inhibiteur.
Le Docteur Hudson est retrouvé mort dans sa voiture, il s’est suicidé laissant un mémo où est inscrit « trouver le pare feu ». Tom et Diana s’interrogent. Avec l’aide de Marco, ils découvrent qu’à l’époque Ryland avait une secrétaire et que forcément celle-ci doit être au courant du programme. Ils vont à sa rencontre, la jeune femme leur remet un dossier. Diana est ravie elle tient enfin la preuve qu’elle cherchait, mais Tom lui l’est beaucoup moins. Il révèle à Diana que son fils a assassiné Collier et que Ryland est au courant.
Lily, de plus en plus mal suite à ses hallucinations, comprend que c’est Isabelle qui en est la cause. Elle décide alors de rejoindre enfin Richard. Kevin Burkhoff peut alors prélever un échantillon de promicine sur Isabelle et mettre sur pied une sorte de vaccin. Puisqu’il y a qu’une unique dose, celle-ci doit être injectée à Shawn, qui guérira ensuite les 4400 malades.
24 heures plus tard
Kyle a décidé d’avouer son crime : il va voir son cousin Shawn et lui annonce qu’il est l’assassin de Jordan Collier. Shawn, par son don, le libère de la chose qui se trouvait en lui. Tom accompagne alors son fils au tribunal. De leur côté, Diana et Marco s’offrent un dîner en tête-à-tête… lorsque Maïa apparaît prononçant cette mystérieuse phrase : « Rien n’est fini. Ca ne fait que commencer. »
Au NTAC Ryland se fait menotter, tandis qu’on aperçoit Burkhoff s’injecter une dose de promicine. On découvre enfin le don de Richard, il déplace les objets par la pensée. Au même instant, Lily surprend le lit d’Isabelle vide… on retrouve alors Isabelle adulte, nez à nez avec Shawn. L’épisode s’achève sur le retour d’un Jordan Collier vieilli sur la plage de Highland Beach.