Alors que le NTAC recherche activement le meurtrier de Jordan Collier, Tom lui tente de découvrir pourquoi Kyle s’est enfuit et surtout où est-il à présent. Il contacte alors Danny qui lui révèle que Kyle souffre d’absence depuis plusieurs semaines et qu’il aurait fait quelque chose de grave durant l’une d’elles. Tom rend ensuite visite à Shawn, mais malheureusement lui non plus n’a pas de nouvelles de son cousin.
Au Centre 4400
Danny fait la connaissance de Liv. Shawn charge la jeune femme de faire visiter le Centre à son frère.
Le NTAC poursuit ses entretiens afin de remonter la piste du tueur. Pendant ce temps, Danny invite Liv à sortir, mais Shawn lui interdit de quitter le Centre au vu des problèmes passés de Liv. Tom toujours sur les traces de son fils contacte Wendy Paulson, la professeur de Kyle. Elle lui raconte avoir un jour retrouver inexplicablement son fils devant sa porte.
Tom essaie d’en savoir davantage sur Kyle auprès de son ex femme, mais celle-ci semble ne rien savoir de plus. Pourtant à peine Tom parti, elle appelle Kyle réfugié dans une maison fermée. Le NTAC lui se rapproche peu à peu du criminel. Tandis que Liv a finalement désobéi à Shawn en sortant avec son frère.
En fouillant la chambre de Kyle, Alana découvre une clé. Dès lors Tom cherche qu’elle peut bien être son utilité. Cette clé ouvre un casier dans un aéroport, il retrouve à l’intérieur une mallette dans laquelle se trouve une arme à feu. Tom aperçoit le NTAC sur les lieux, il demande alors à Alana de s’enfuir et de cacher cette mallette au mieux. Tom est désormais certain que son fils est l’assassin de Jordan Collier.
Suite à un malentendu, Tom comprend que son ex femme en sait plus qu’elle ne veut bien le dire au sujet de Kyle. Il la prend alors en chasse et découvre qu’elle cache leur fils. Tom retrouve enfin Kyle. Ce dernier lui avoue tout, Tom décide de le protéger et donc pour cela de le faire quitter la ville dans les plus brefs délais.
Le NTAC a arrêté le meurtrier de Jordan Collier, du moins c’est ce qu’il croit… en apprenant cela Tom fait revenir Kyle. Il considère l'affaire close.
